El uso de información genética es ahora indispensable para el fitomejoramiento moderno. Aunque la secuenciación del ADN se ha vuelto mucho más barata desde que se descodificó el genoma humano por primera vez en 2003, la recopilación de la información genética completa sigue representando una gran parte de los costes de la cría de animales y plantas.
por la Universidad de Göttingen
Un truco para reducir estos costos es secuenciar solo una parte muy pequeña y seleccionada al azar del genoma y completar los vacíos restantes utilizando técnicas matemáticas y estadísticas. Un equipo de investigación interdisciplinario de la Universidad de Göttingen ha desarrollado un nuevo enfoque metodológico para esto, que ha sido publicado en la revista PLoS Genetics.
«La idea central del método es reconocer ‘bloques de haplotipos’, con lo que nos referimos a secciones más largas del genoma que son muy similares en diferentes plantas debido a la herencia, y utilizar esta estructura de mosaico para compilar el resto de la información». dice el Dr. Torsten Pook del Centro de Investigación de Mejora Integrada de la Universidad de Göttingen. «En las poblaciones reproductoras, las secuencias completadas con este nuevo método tienen una calidad comparable a la de recopilar cien veces más información de la cadena de ADN». El objetivo de los investigadores es cultivar plantas de maíz con baja susceptibilidad a los daños por heladas y sequías como parte del proyecto MAZE. KWS Saat SE, socio del proyecto, ya está utilizando el método en programas de mejoramiento debido a su rentabilidad.
«Otra ventaja es que el método no solo nos permite detectar diferencias en los nucleótidos individuales en la cadena de ADN, sino también reconocer diferencias estructurales que hasta ahora han sido prácticamente inutilizables para fines de reproducción», dice Pook. Sin embargo, tal como están las cosas, actualmente el método solo se puede usar de manera eficiente para líneas endogámicas en el fitomejoramiento. Ya está planificado un estudio de seguimiento para extender el método a organismos con un doble juego regular de cromosomas. Esto significaría que su nuevo método podría usarse para la mayoría de los vertebrados, incluidos los humanos.
La investigación fue publicada en PLoS Genetics .
