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La secuenciación de alto rendimiento rastrea la propagación histórica de los virus de la vid


Grapevine está infectado por más de 90 virus, con nuevas especies virales descubiertas anualmente como resultado de la tecnología más nueva introducida por High-Throughput Sequencing (HTS).


por la American Phytopathological Society


En la última década, HTS se utiliza para la identificación de viromas (el ensamblaje de genomas virales), lo que a su vez ayuda a los patólogos de plantas con futuras investigaciones.

Un grupo de científicos con sede en Francia utilizó la extracción de datos sistemática para recopilar información sobre dos trichovirus de la vid , el virus Pinot gris de la vid (GPGV) y el virus de la necrosis interna de la baya de la vid (GINV). Pudieron capturar nuevos genomas virales completos de todo el mundo. Recopilaron esta información utilizando sus propios conjuntos de datos HTS y aprovechando las bases de datos mundiales de HTS. Esta información compilada ayudó a desentrañar la historia evolutiva de estos dos virus emergentes que muestran una nueva amenaza para la viticultura.

Su trabajo mostró que GPGV y GINV probablemente se originaron en Asia. GPGV se introdujo en Europa en los años 50 o 60 y desde allí se trasladó a América del Sur y del Norte durante los años 80 y 90, como resultado del aumento de las tierras dedicadas a la industria del vino. Curiosamente, todos los movimientos intercontinentales de GPGV parecen haber ocurrido antes de que el virus fuera identificado y caracterizado en Italia en 2012.

También descubrieron que si bien los dos virus estaban estrechamente relacionados, también variaban mucho en su éxito epidemiológico. Ellos plantearon la hipótesis de que esta diferencia podría ser el resultado de medidas de control y cuarentena exitosas aplicadas en la transferencia intercontinental de material en relación con el GINV altamente sintomático, evitando que se propague, mientras que estas mismas medidas han sido ineficaces para el GPGV que a menudo muestra síntomas heterogéneos en la vid.

«Este trabajo es el primero de su tipo, redefiniendo la historia evolutiva mundial de dos virus que infectan plantas», dijo Jean-Michel Hily, primer autor del artículo. «Si bien el trabajo anterior mostró algunos movimientos importantes de los virus vegetales , siempre se limitaron al nivel del continente, nunca se describieron a escala mundial como se presenta en nuestro documento».

Hily también comenta sobre el poder de la combinación de HTS y otras herramientas de modelado. «El programa que utilizamos nos dio algunas fechas de movimientos virales entre países y continentes que se correlacionaron de manera impresionante con la historia de la vid en todo el mundo».


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