Agricultura Botánica y Genética Europa

Mejora del genoma del cacao y fitozoma


Según la Organización Internacional del Cacao (ICCO), la producción mundial de cacao en grano en 2017-2018 fue de 4.6 millones de toneladas métricas.


por DOE / Joint Genome Institute


Las marcas globales de chocolate no podrían existir sin el cacao. Pero hoy en día la planta está bajo amenaza debido al cambio climático y las devastadoras infecciones por hongos.

Es por eso que Mars, Inc., fabricante de chocolate por más de 100 años y uno de los mayores compradores de cacao del mundo, está colaborando con otros para desarrollar plantas de cacao más sanas y productivas y asegurar que haya cacao para el chocolate mañana.

En 2010, un consorcio liderado por Mars, Inc. lanzó un borrador del primer genoma de Theobroma cacao , el árbol que produce granos de cacao , a través del proyecto Base de datos del genoma del cacao. La secuencia del genoma fue ensamblada por el equipo de la planta en el HudsonAlpha Institute for Biotechnology.

Un genoma de referencia actualizado para T. cacao ahora se ha completado y publicado por los científicos de HudsonAlpha que, con la ayuda de los fondos de Mars Wrigley. El genoma anotado se ha actualizado a un estándar moderno de alta calidad e incluye datos de RNA-seq.

El genoma mejorado T. cacao Matina 1-6 ahora está disponible para fines comparativos en la última versión del portal de plantas JGI Phytozome en phytozome-next.JGI.doe.gov.

Uno de los objetivos en la actualización de la anotación del genoma fue desarrollar un nodo de alta calidad para el cacao utilizado para la ortología sistémica para permitir el uso tanto para la biología funcional como para la reproducción del cacao.


Leer más


Deja un comentario

Tu dirección de correo electrónico no será publicada. Los campos obligatorios están marcados con *