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Nuevo software ayuda a los fitomejoradores a dar lo mejor de sí


El brócoli está en el ojo del espectador. Una cabeza de brócoli que podría atraer a una persona, tal vez debido a su color verde intenso, puede dejar otra fría, debido a una forma asimétrica o cogollos demasiado grandes.


por Melanie Lefkowitz, Universidad de Cornell


Los investigadores de Cornell que participan en el Proyecto de Brócoli del Este, que apunta a producir variedades de brócoli adecuadas para crecer en la Costa Este, han ideado un método estadístico para estandarizar las evaluaciones del brócoli, a fin de que las decisiones de fitomejoramiento sean más consistentes y eficientes.

Ahora un grupo de Cornell: el estudiante de doctorado Zachary Stansell; Thomas Björkman, profesor de horticultura en Cornell AgriTech; y Deniz Akdemir, de la Unidad de Consultoría Estadística de Cornell, ha lanzado RateRvaR, un nuevo software basado en este método. RateRvaR está disponible gratuitamente, es de código abierto , fácil de usar y aplicable a los criadores de cualquier vegetal, árbol o flor con características subjetivas.

Usando el software, los criadores pueden seleccionar rasgos y pedir a varias personas que realicen la misma evaluación. Luego, el programa analizará esos datos para determinar qué rasgos son más o menos importantes para predecir la calidad general, en parte priorizando los rasgos que son más fáciles de juzgar objetivamente, como el tamaño o el color.

«El desafío para los criadores, cuando buscan adaptaciones más amplias, es que para ciertos cultivos, siembras por todo el lugar y vuelas a varios lugares del mundo para hacer las evaluaciones tú mismo», dijo Björkman.

«¿Pero qué pasaría si tuvieras que revisar la planta dos veces por semana durante un mes porque está madurando a ritmos diferentes? No puedes estar volando en todo el mundo; simplemente se vuelve poco práctico», dijo. «Los criadores quieren saber no solo cómo otra persona calificaría una planta, sino cómo la calificarían ellos mismos, o cómo un consumidor idealizado la calificaría. Esto debería brindar la oportunidad a los criadores de realizar evaluaciones en múltiples ubicaciones».

El software también puede identificar rasgos que no parecen relevantes para la calidad general, por lo que los mejoradores pueden recopilar menos datos y obtener resultados precisos.

«Este enfoque puede estandarizar las evaluaciones y hacerlas más rápidas y eficientes, y también puede revelar sesgos individuales en la forma en que un humano puede responder a una variedad particular de un vegetal o planta», dijo Stansell. «En el caso del brócoli, queríamos eliminar la subjetividad humana de estas evaluaciones, y este método nos permite ver esos sesgos y corregirlos».

Los investigadores en el Proyecto de Brócoli del Este cultivan al menos 40 variedades de brócoli al año, con el objetivo de encontrar variedades que prosperen en climas particulares, desde Florida en el invierno hasta Maine en el verano. Su objetivo no es solo criar plantas bien adaptadas a los climas locales, sino producir brócoli de alta calidad que los consumidores comprarán.

Pero Stansell notó que él y sus colegas a menudo tenían criterios muy diferentes para juzgar las plantas de brócoli. Él tendía a elegir cabezas que eran muy simétricas, mientras que otro investigador estaba más interesado en el color de la cabeza.

No solo sus preferencias eran inconsistentes, ni siquiera estaba claro si eran realmente significativos para predecir la calidad general de la planta, una caracterización obstinadamente subjetiva.

«Estábamos tratando de lograr un control firme sobre lo que es el brócoli de buena calidad: lo sabes cuando lo ves, pero es difícil de definir con precisión», dijo Stansell. «Hay muchas partes móviles genéticamente que deben unirse».

Junto con sus colegas, creó un sistema de puntuación y recopiló datos de años sobre los rasgos que consideraron significativos. Utilizaron estos datos para desarrollar RateRvaR, que se basa en el análisis de importancia relativa, una técnica estadística que calcula la importancia de las diferentes cualidades en relación con las demás.

«Nos mostró con qué rasgos tuvimos la oportunidad de progresar mucho y qué rasgos realmente no importaban», dijo Stansell. «También nos permitió desarrollar prioridades. Por ejemplo, la forma de la cabeza es realmente importante, mientras que tal vez el tamaño de los brotes es menos importante, por lo que debemos centrarnos en la forma de la cabeza y utilizar nuestro escaso tiempo y recursos para tratar de mejorar». este aspecto particular «.


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