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Ranas perdidas redescubiertas con ADN ambiental

rana
Crédito: CC0 Public Domain

Los científicos han detectado signos de una rana en la lista de extintos y no vista desde 1968, utilizando una técnica innovadora para localizar especies en declive y desaparecidas en dos regiones de Brasil.


por la Universidad de Cornell

La rana, Megaelosia bocainensis , se encontraba entre las siete especies en total, incluidas otras cuatro especies en declive y dos que habían desaparecido localmente durante muchos años, que fueron detectadas. Los hallazgos aparecieron en un artículo, «Perdidos y encontrados: ranas en un punto caliente de biodiversidad redescubiertas con ADN ambiental», publicado en agosto en Molecular Ecology .

Megaelosia bocainensis . Una especie desaparecida del Parque Nacional da Serra da Bocaina, Brasil, conocida solo de este espécimen de museo recolectado en 1968, y detectado por encuestas de eDNA. En el estudio, los investigadores recolectaron y analizaron ADN ambiental (eDNA) en la biodiversidad del Bosque Costero Atlántico y Pastizales del Cerrado de Brasil.

La técnica de eDNA ofrece una forma de estudio que puede confirmar la presencia de especies no detectadas por métodos tradicionales, proporcionando una herramienta para que los científicos de la conservación evalúen la presencia de especies amenazadas, especialmente aquellas con densidades de población bajas y aquellas que no se ven en años.

Después de una cuidadosa investigación para identificar especies en varios niveles de amenaza en estas regiones de Brasil, los investigadores utilizaron el método eDNA para buscar 30 especies de anfibios objetivo en seis localidades donde se sabía que las ranas vivían anteriormente.

«Pequeños fragmentos de ADN en el medio ambiente no nos dicen cuántos individuos hay o si esos individuos están sanos, pero sí nos dice que la especie todavía está presente», dijo el autor principal Kelly Zamudio, profesor de Goldwin Smith de Ecología y Biología Evolutiva en la Facultad de Artes y Ciencias.

«Este es un tipo más de datos de encuestas, y para las especies que están disminuyendo o desaparecieron localmente, no solo significa que están allí, sino que ahora existe la posibilidad de estudiarlas con más detalle», dijo, y señaló que para muchas especies, se sabe muy poco.

En todo el mundo, los conservacionistas se han enfrentado al desafío de seguir el ritmo de la disminución y desaparición de los anfibios. Al mismo tiempo, los organismos vivos dejan rastros de ADN en el suelo, el agua y el aire. Ahora, los científicos utilizan cada vez más técnicas de muestreo altamente sensibles para detectar eDNA con fines de conservación.

En el estudio, los investigadores apuntaron a 13 especies de ranas que han desaparecido por completo y se presume extintas; 12 ranas que han desaparecido localmente pero que todavía se encuentran en otras partes de su área de distribución; y cinco especies que alguna vez fueron muy abundantes y que aún existen pero son difíciles de encontrar.

Los investigadores caminaron hacia los sitios de muestreo llevando paquetes de baterías, una bomba peristáltica del tamaño de una caja de zapatos y mochilas con tubos estériles. Utilizaron la bomba y el tubo para extraer hasta 60 litros de agua de arroyo o estanque a través de una cápsula equipada con un filtro para capturar ADN. Luego se aplicó un tampón para estabilizar y conservar el ADN en el filtro.

De vuelta en el laboratorio, los investigadores extrajeron el ADN, lo secuenciaron genéticamente, eliminaron el material genético de humanos, cerdos, pollos y otros organismos hasta que pudieron aislar todo el ADN de la rana .

«Ahora tiene un subconjunto de secuencias genéticas que sabemos que solo pertenecen a las ranas, y luego es paso a paso, yendo cada vez más fino, hasta llegar al género y especie que está buscando», dijo Zamudio.

La identificación de M. bocainensis requirió un ingenioso trabajo de detective: la especie desapareció hace mucho tiempo y no había tejidos de los que extraer el ADN para compararlo con el eDNA. Pero los investigadores tenían las secuencias de todas las especies hermanas del género Megaelosia y conocían los rangos de las especies hermanas y M. bocainensis .

«Sabemos que hay una Megaelosia allí», dijo Zamudio, «simplemente no sabemos cuál es, pero la única que se ha reportado allí históricamente es la que desapareció. ¿Lo creemos? Hasta ahí. el análisis nos puede llevar «.

Zamudio agregó que vale la pena recolectar muestras de áreas cercanas para detectar más signos de M. bocainensis .


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