El frotis de los bebederos del ganado será útil tanto en las pruebas genómicas de resistencia a los antimicrobianos como para detectar enfermedades respiratorias.
Los hisopos de los abrevaderos del ganado pueden proporcionar información valiosa sobre la enfermedad respiratoria bovina y los genes de resistencia a los antimicrobianos en bacterias, afirma Murray Jelinsky, profesor de la Facultad de Medicina Veterinaria Occidental de la Universidad de Saskatchewan, según Alexis Kinlen en un artículo para el Alberta Farmer Express de Canadá. Hace unos siete años, Jelinsky leyó un estudio australiano que reveló que uno de los principales factores de riesgo para la propagación de la enfermedad respiratoria bovina era compartir abrevaderos entre el ganado.
“Nos preguntábamos si había algo en el agua. Nunca lo habíamos mirado”, recuerda Jelinski, titular de la Cátedra de Investigación en Medicina de la Producción y Salud de la Carne de Res de Alberta. Casi al mismo tiempo, Stuart Thiessen, propietario de Namaka Farms, que cuenta con un gran corral de engorde en Alberta, abrió otro en Outlook, Saskatchewan.
Jelinski señaló que la apertura del nuevo corral de engorde brindó la oportunidad de realizar investigaciones en un corral que nunca antes había tenido animales. Los investigadores pudieron estudiar las poblaciones bacterianas en los bebederos y observar cómo cambiaban con la incorporación de animales.
A medida que se añadían más animales al corral de engorde, aumentaba la cantidad de genes de resistencia en las bacterias. «Observen la biopelícula, la masa de bacterias que crece en los bebederos, por donde también entra el alimento de la boca de los animales. Si van a cualquier corral de engorde y observan los bebederos, probablemente verán algo parecido a una baba en el borde del agua. Está llena de todo tipo de bacterias del entorno, y cuanto más se trate al ganado con antibióticos, más resistencia desarrollará», afirma el investigador.
Los factores bacterianos contribuyen al desarrollo de enfermedades respiratorias. Los animales presentan fiebre y dificultad para respirar. Dejan de moverse y comen y beben menos.
Los científicos se preguntaban si podrían encontrar bacterias que causan enfermedades respiratorias en el ganado en bebederos. El estudiante de posgrado Daniel Kos comenzó a buscar en los bebederos tipos específicos de bacterias asociadas con enfermedades respiratorias, y el equipo dedicó más de dos años a desarrollar un medio que aislara los patógenos que buscaban de otras bacterias presentes. Jelinsky observó que analizar las bacterias en los bebederos es mucho más fácil y rápido que tomar muestras de la nariz del ganado.
El siguiente paso fue determinar si la resistencia a los antimicrobianos podía monitorearse de esta manera. Resultó que sí. También se confirmó que, a medida que aumentaba el uso de antimicrobianos, las bacterias se volvían más resistentes a ellos.
Kos analizó todos los datos genómicos publicados por el Centro Nacional de Información Biotecnológica como un único conjunto de datos. Todos los investigadores que realizan investigaciones genómicas y publican resultados deben subir sus datos genómicos al GenBank del NCBI.
Kos descubrió una de las fallas del estudio al examinar 4000 archivos de datos genómicos. Gran parte de los datos no fueron concluyentes en cuanto al lugar exacto donde el ganado contrajo el SRB. Ni siquiera un revisor humano que analizara los datos y detectara la resistencia a los antimicrobianos podría determinar detalles clave, como si un animal murió de SRB o fue llevado a un corral de engorde con la enfermedad.
Jelinski afirmó que el estudio demostró que el perfil patógeno de la enfermedad en Norteamérica es diferente al de otras partes del mundo: «Tenemos niveles más altos de resistencia a los antimicrobianos. Esto probablemente se deba a la forma en que criamos el ganado y a los corrales de engorde más grandes. En Europa Central no hay corrales de engorde para 20.000 o 30.000 animales».
En Norteamérica, el ganado se cría con más antimicrobianos, y su uso está provocando una mayor resistencia bacteriana. En las últimas dos décadas, expertos en salud pública han desarrollado directrices para el uso prudente de antimicrobianos con el fin de reducir su uso. Sin embargo, es imposible eliminar por completo los antibióticos tanto en la medicina humana como en la veterinaria.
Curiosamente, algunas bacterias a veces pierden sus superpoderes cuando se produce un cambio en el ADN que inactiva el gen de resistencia.
Por lo tanto, es necesario identificar la resistencia antimicrobiana individual en el corral de engorde, y esto se puede hacer fenotípicamente mediante hisopados y siembra de muestras. El problema es que lleva tiempo. Los resultados pueden tardar días o más, dependiendo de las bacterias y su velocidad de crecimiento. Y ahora, gracias a la velocidad y precisión de los resultados, todos se están orientando a la genómica. Hace unos 10 o 12 años, secuenciar un genoma costaba 1000 dólares, y ahora cuesta 100 dólares y sigue bajando. Estamos desarrollando un método para hisopar un bebedero, extraer todo el ADN del hisopado, secuenciarlo y reensamblarlo para determinar su contenido. Con el tiempo, la tecnología madurará y estará disponible para la investigación práctica en la granja, concluyó el investigador.
Fuente: Alberta Farmer Express. Autor: Alexis Kinlen.
