Se ha descubierto que un virus previamente desconocido ocurre en todo el mundo en la especie de planta más estudiada, el berro thale (Arabidopsis thaliana).
La presencia del virus, que fue descubierto por investigadores de la Universidad de Utrecht y la Universidad e Investigación de Wageningen, tiene potencialmente implicaciones de gran alcance para los proyectos de investigación. En un artículo en la revista científica New Phytologist, los investigadores aconsejan a los científicos de plantas que evalúen sus semillas de berro thale para detectar la presencia del virus antes de usarlas en experimentos.
Altamente contagioso
Los investigadores realizaron varios experimentos para obtener información sobre cómo el virus afecta a las plantas. Se encontró que las plantas infectadas contenían un poco menos de clorofila y toleraban mejor la sequía. Debido a que el virus no causa ningún otro síntoma visible, los investigadores lo llamaron virus latente 1 de Arabidopsis (ArLV1).
Los investigadores descubrieron que el virus es altamente transmisible: el 40 por ciento de las plantas que crecen a partir de las semillas de un berro thale infectado dieron positivo para el virus. Los investigadores también lograron transmitir el virus de un berro thale infectado a berros thale sanos.
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Contaminación de conjuntos de datos
Pero, ¿cómo se detecta un virus que no causa síntomas evidentes? Surgió cuando los investigadores intentaron analizar el ARN de varios berros thale. Las moléculas de ARN juegan un papel importante en la producción de proteínas, entre otras cosas.
La investigadora de UU, la Dra. Ava Verhoeven, que trabajó en un conjunto de datos de ARN infectado con virus en Wageningen hace varios años, descubrió más o menos por casualidad que existían problemas similares en un conjunto de datos de Utrecht como en el de Wageningen. Verhoeven: «En ambos conjuntos de datos, resultó que en algunas muestras más del 90 por ciento del ARN no era de berro thale, sino de otra cosa. En Wageningen, el ARN desconocido ya se había comparado con el ARN de una gran base de datos. luego quedó claro que el ARN tenía que ser de un virus desconocido. Y cuando comparamos el ARN desconocido del conjunto de datos de Utrecht con el ARN viral de Wageningen, resultó ser del mismo virus desconocido».
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Ocurrencia mundial
Luego, los investigadores de Wageningen decidieron ver si también podían encontrar el virus en conjuntos de datos publicados en línea por otros investigadores. Encontraron el ARN completo del virus en el 8,5 por ciento de los conjuntos de datos y en casi el 25 por ciento de las diferentes líneas de berros thale disponibles, lo que indica que el virus ya se ha propagado por todo el mundo.
Trabajo y dinero tirado
Es por eso que Verhoeven está seguro de que el virus no solo ha causado conjuntos de datos inutilizables en Utrecht y Wageningen. «Thale berro es la planta modelo», dice Verhoeven. «Ahora que nuestra publicación está disponible, muchos investigadores se comunicaron con nosotros para informarnos que reconocen los problemas con los conjuntos de datos. Pero simplemente no sabían que fue causado por este virus».
“Los conjuntos de datos de ARN que contienen muy poco ARN de plantas se consideran fácilmente fallas. Los resultados a menudo no se publican y, por lo tanto, otros investigadores no pueden encontrarlos en línea. Así permaneció oculto el virus, a pesar de estar muy extendido. Por lo tanto, el porcentaje real de conjuntos de datos «infectados» es probablemente mucho mayor que el 8,5 por ciento. La creación de esos conjuntos de datos costó mucho tiempo y dinero, mientras que la presencia del virus hizo que no fueran muy útiles”.
Cribado de todas las plantas.
Al probar plantas silvestres de los Países Bajos y España, los investigadores descubrieron que el virus también está presente en la naturaleza. Eso hace que sea probable que el virus haya estado circulando entre las plantas de berro thale en la naturaleza durante algún tiempo, y en algún momento llegó al laboratorio. El hecho de que los investigadores a menudo intercambien semillas de berro thale permite que el virus se propague fácilmente.
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Verhoeven y sus colegas recomiendan que los investigadores evalúen sus semillas de berro thale para detectar la presencia del virus antes de crear grandes conjuntos de datos. Verhoeven: «Evidentemente, desea evitar la presencia de un virus en las plantas que está utilizando en su investigación. No solo porque puede producir conjuntos de datos inutilizables, sino también porque el virus podría afectar a las plantas de maneras aún desconocidas. Por eso hemos puesto a disposición un protocolo que permite a cualquier investigador detectar fácilmente la presencia del virus en sus plantas.”
