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Una misión para digitalizar 1 millón de especímenes de plantas



El Herbario Nacional de Australia en Canberra está tomando imágenes de casi un millón de especímenes de plantas utilizando un sistema automatizado desarrollado por la empresa holandesa Picturae.


por CSIRO


El líder del grupo de digitalización e informática de CSIRO, Pete Thrall, que supervisa los activos digitales en National Research Collections Australia, administrado por CSIRO, la agencia científica nacional de Australia, dijo que el proyecto ayudaría a informar la recuperación de incendios forestales y la bioseguridad.

«La digitalización del herbario es un gran avance para compartir especímenes para la investigación. Como resultado, podremos proporcionar información rápidamente para proyectos como la recuperación de incendios forestales y la bioseguridad», dijo Thrall.

«La creación de una réplica digitalizada también proporciona seguridad para los especímenes físicos irremplazables del herbario», dijo.

La gerente de imágenes de Parks Australia, la Sra. Emma Toms, ubicada en el Herbario Nacional de Australia, que está coordinando el proyecto Picturae, dijo que el trabajo se completaría en los próximos 9 meses.

«Digitalizar estos especímenes en casa nos hubiera llevado unos ocho años usando un equipo de cámara estándar», dijo.

«El primer paso es una verificación visual de cada espécimen para asegurarse de que esté en buenas condiciones y tenga un código de barras para vincularlo a su registro digital.

«Tres personas operan la cinta transportadora de Picturae, que mueve los especímenes debajo de una cámara para tomar una fotografía de alta resolución. Dos personas desempacan los especímenes al comienzo de la cinta transportadora y una persona vuelve a empaquetar los especímenes y revisa las fotografías en busca de errores», dijo. dijo.

Una de las nuevas tecnologías que está transformando la utilización de las colecciones es la inteligencia artificial (IA).

El postdoctorado de CSIRO, el Dr. Abdo Khamis, dijo que el aprendizaje automático y la IA permiten a los investigadores extraer información de rasgos de las imágenes.

«Podemos usar especímenes de herbario digitalizados para comprender cómo las plantas están respondiendo al cambio climático , por ejemplo, determinando cómo la estructura reproductiva de las flores está cambiando con el tiempo», dijo.

El equipo continuará aumentando los activos digitales del herbario a medida que se agreguen a la colección más especímenes de plantas de Australia y la región.

«Tendremos un programa de digitalización interno una vez que se complete este proceso, por lo que se fotografiarán nuevos especímenes antes de incorporarlos a la colección», dijo Emma Toms.

La colección digital completa del Australian National Herbarium estará disponible a través del Atlas of Living Australia, incluso para el público en general.



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