Científicos en Ecuador han desarrollado un nuevo método para detectar y diagnosticar un virus que devasta los cultivos de babaco, una planta frutal de importancia económica para los agricultores locales.
Por Linda Stewart, Microbiología Aplicada Internacional
El equipo, de la Universidad San Francisco de Quito en Ecuador, desarrolló cebadores específicos de especie y género para detectar el virus del mosaico del babaco (BabMV) y sus parientes más cercanos mediante RT-PCR y RT-qPCR.
La investigación se describe en un artículo, “Desarrollo de nuevos cebadores específicos de especie y género para la detección del virus del mosaico de Babaco (BabMV)”, que aparece en Letters in Applied Microbiology .
Los nuevos cebadores contribuirán a una detección precisa de este virus y a una mejor gestión del cultivo de babaco en Ecuador, afirma la autora correspondiente, Dra. María de Lourdes Torres.
Cultivar híbrido
El babaco (Vasconcellea heilbornii var. Pentagona Badillo) es un cultivar híbrido estéril de la familia Caricaceae, resultado del cruce interespecie entre Carica pubescens (chamburo) y Carica provisionsa (toronche). Es originario de las regiones subtropicales de Ecuador y Colombia, explicó.
“Su fruto tiene un alto contenido nutricional y un delicado sabor y aroma ácido, lo que lo hace atractivo para la comercialización internacional. La producción de babaco es una de las principales fuentes de ingresos para cientos de familias de la sierra ecuatoriana”, afirmó el Dr. Torres.
“Las plantas de babaco se ven afectadas por varios fitopatógenos que causan pérdidas significativas en los cultivos. Los virus son motivo de especial preocupación, ya que no solo reducen el rendimiento de los cultivos y dañan los frutos, sino que también reducen la vida útil de las plantas. Este problema genera gran preocupación entre los cultivadores de babaco.
“La amenaza que representan los virus, especialmente el Virus del Mosaico del Babaco (BabMV), para la producción del cultivo del babaco hace necesario desarrollar técnicas eficientes de detección y diagnóstico para promover la producción de este cultivo y mejorar la economía de los agricultores locales en Ecuador”.
Nuevos cebadores específicos para cada especie
El equipo desarrolló nuevos iniciadores específicos de especie para detectar BabMV que se dirigían a una región de 165 pb de la proteína de la cubierta (CP). Los iniciadores específicos de género fueron diseñados para validar los iniciadores específicos de especie y dar fe de su capacidad para discriminar entre BabMV y sus parientes más cercanos. Estos iniciadores se dirigían a un fragmento de 175 pb de la región CP.
Se eligieron los conjuntos de cebadores más eficaces para la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR) y la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa cuantitativa basada en SYBR Green (RT-qPCR) en plantas de babaco sintomáticas y asintomáticas.
Entre 28 plantas analizadas, 25 fueron positivas y tres fueron negativas para BabMV utilizando cebadores específicos de especie y género en RT-PCR y RT-qPCR, mientras que el control positivo de PapMV utilizado se detectó con los cebadores específicos de género y fue negativo para los cebadores específicos de especie.
De esta manera, los científicos estandarizaron un protocolo que podría ser utilizado para detectar BabMV y sus parientes más cercanos en cultivos de babaco y contribuir a una producción más eficiente de esta fruta en Ecuador.
La magnitud de la amenaza del virus
Lo que resultó sorprendente fue la magnitud de la amenaza que representaba el virus.
“El virus del mosaico del babaco (BabMV) parece ser un fitopatógeno muy prevalente en las plantas de babaco, incluso en aquellas cultivadas en condiciones de invernadero. Nuestro estudio, que se centró en plantas de babaco de vivero, destaca la naturaleza generalizada y la gran preocupación que representa este virus en Ecuador”, afirmó el Dr. Torres.
“La presencia de BabMV afecta tanto la seguridad alimentaria como la sostenibilidad económica de muchos agricultores locales en Ecuador.
“Los resultados de nuestra investigación arrojan luz sobre una metodología que también podría desarrollarse para otros patógenos de plantas que afectan a cultivos económicamente importantes en toda la región. Los métodos de detección y diagnóstico eficientes son el primer paso para controlar las enfermedades que reducen la producción y el rendimiento de los cultivos.
“De esta manera, los iniciadores desarrollados en este estudio ayudarán a identificar cultivos afectados en el país y comenzar a desarrollar estrategias para manejar las enfermedades causadas por BabMV y sus parientes más cercanos”.
Tamaño de muestra más grande
Los estudios futuros requerirán un tamaño de muestra más diverso para fortalecer y validar la robustez de los cebadores, dijo el Dr. Torres.
“Nuestro estudio se limitó a plantas de babaco de vivero de tres localidades diferentes en Ecuador, lo que sirvió como prueba preliminar de nuestros cebadores en un grupo de plantas accesible y asequible en ese momento. Los estudios posteriores deberían incluir un tamaño de muestra más grande de varias ubicaciones para validar aún más nuestros resultados. Además, las investigaciones futuras deberían incluir plantas que crecen en el campo, no solo en viveros, para obtener una comprensión más amplia de la validez de nuestros cebadores”.
El estudio fue dirigido por cuatro científicas ecuatorianas de la Universidad San Francisco de Quito (USFQ) del Laboratorio de Biotecnología Vegetal.
Más información: Martina Albuja-Quintana et al, Desarrollo de nuevos iniciadores específicos de especie y género para la detección del virus del mosaico de Babaco (BabMV), Letters in Applied Microbiology (2024). DOI: 10.1093/lambio/ovae070
